En gros: tu acceptes de te prendre des issues pour que ton Makefile en upstream puisse être adapté pour fonctionner aussi bien sur Deb que le reste des autres distribs, alors même que c'est de la faute de Deb.
Moi je dis: à Debian d'être raccord avec la communauté Linux, respecter les normes, les nommages, les répertoires. Pour ne pas que ce soit à moi de corriger leur bêtises.